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科研团队

瓜类蔬菜遗传育种与分子生物学团队

 

 

 

团队简介:

瓜类蔬菜遗传育种与分子生物学团队首席专家为陈学好教授。陈学好教授是江苏省黄瓜育种首席专家,江苏省黄瓜产业技术创新战略联盟理事长、江苏省科协农村技术服务中心乡村振兴特聘专家、江苏淮阴黄瓜科技小院首席科学家、Vegetable Research 副主编。团队成员包括徐强教授、齐晓花教授、杨晓东教授、崔北米教授,许学文副教授、徐君副教授、蔡丛希博士,张丽丽副教授,解庆敏博士和马银波博士。团队以我国主要栽培的具有重要经济价值的园艺作物-黄瓜和西瓜为对象,在黄瓜中研究其重要农艺性状(单性结实、果肉厚度、果把长度、果皮色和亮度)、品质性状(糖、芳香物质和植物多酚含量)、生物胁迫(白粉病、霜霉病、枯萎病和蚜虫、蓟马)及非生物胁迫(涝和高温)的遗传与发育机制;在西瓜中主要研究其品质和抗逆性状优异基因挖掘与分子遗传改良。

 



主要研究方向与目标

研究方向:

黄瓜耐热新品种选育与推广、优质高效栽培技术示范推广(徐强 蔡丛希)

黄瓜耐涝性机理、单性结实遗传育种、蓟马抗性遗传机制解析(齐晓花 陈学好解庆敏)

黄瓜表观遗传机制、抗蚜遗传育种、组织再生机理与遗传转化,西瓜品质遗传育种(杨晓东 张丽丽 马银波)

黄瓜耐涝、白粉病抗性及果实外观与功能品质遗传育种、瓜类蔬菜设施优质栽培技术(陈学好 许学文 马银波)

黄瓜、西瓜抗病抗逆性状遗传育种与生物技术(崔北米 徐君 陈学好 马银波 )黄瓜果实外观与功能品质遗传育种与生物技术(陈学好 蔡丛希 )

目标:综合利用传统与现代生物技术,培育抗逆抗病、优质高产的瓜类蔬菜新品种,并研发应用设施高效栽培技术,实现品种持续创新升级,产业显著提质增效。


承担主要项目(近5年):

国家自然科学青年基金,CsARN6.1调控淹涝胁迫下黄瓜不定根形成的机制解析 (31801883),2019-2021

国家自然科学青年基金,黄瓜枯萎病菌FocRho1基因沉默诱导抗枯萎病机制解析(31902015),2020-2022

国家自然科学基金面上项目,黄瓜CsRBOH调控不定根形成提高耐涝性的分子机理研究(31972422),2020-2023

国家自然科学基金(重点项目),乙烯与茉莉酸协同调控黄瓜耐涝性的分子机制研究(32030093),2021-2025

国家重点研发计划,瓜类蔬菜优质多抗适应性强新品种培育(2018YFD0100700),2018-2020

国家自然科学基金面上项目,CsERF7-4调控黄瓜耐涝性的功能解析(32172570),2022-2025

国家自然科学基金面上项目,C2H2转录因子CsZFP6 调控黄瓜亮度的分子机制解析(32272718),2023-2026

国家自然科学基金面上项目,CsSUS3诱导根原基分化调控黄瓜耐涝性的分子机制(32272739),2023-2026

国家自然科学青年基金,CsRBOHD调控黄瓜抗蚜性的机理研究(BK20230574),2024-2026

江苏省自然科学青年基金,CsRbohD介导的茉莉酸信号调控黄瓜抗蚜性的机制研究(32302534),2023-2026

江苏省自然科学青年基金,生长素信号CsIAA14-CsARF6 调控黄瓜单性结实果实发育的机理研究(BK20240905),2024-2027

国家自然科学基金面上项目,CsHMGR1介导甲羟戊酸合成调控黄瓜枯萎病抗性的分子机制(32372690),2024-2027

国家自然科学基金青年育种专项,黄瓜蚜虫诱导抗性表观遗传关键因子挖掘与育种应用(32341043),2024-2028

国家自然科学青年基金,CsIAA4介导的生长素信号调控黄瓜单性结实的分子机制研究(32402587),2025-2027

国家自然科学基金区域创新发展联合基金(重点项目),黄瓜单性结实果实发育机制解析及分子设计育种(U24A2041),2025-2028

农业重大技术协同推广计划,黄瓜绿色调优栽培关键技术协同推广计划(2021-ZYXT-05-3),2021-2023

江苏省种业振兴揭榜挂帅项目,瓜菜种质资源优异功能基因挖掘及生物育种核心技术研发(JBGS〔2021〕018),2022-2026

江苏省重点研发(现代农业)重点项目,果菜类蔬菜重要品质及抗逆基因挖掘与分子育种,BE2022339, 2022-2026

江苏省农业科技自主创新,黄瓜功能性品种“玉秀2号’关键生产技术创新与应用,CX(23)1009,2023-2026


 

代表性论文:

Yang Y, Cai CX*, Wang YP, Wang YR, Ju HL, Chen XH*. Cucumber glossy fruit 1 (CsGLF1) encodes the zinc finger protein 6 that regulates fruit glossiness by enhancing cuticular wax biosynthesis. Horticulture Research, 2022, 10(1): uhac237.

Zhang LL, Huang JB*, Su SQ, Wei XC, Yang L, Zhao HH, Yu JQ, Wang J, Hui JY, Hao SY, Song SS, Cao YY, Wang MS, Zhang XW, Zhao YY, Wang ZY, Zeng WQ, Wu HM, Yuan YX*, Zhang XS, Cheung AY, Duan QH*. FERONIA receptor kinase-regulated reactive oxygen species mediate self-incompatibility in Brassica rapa. Current Biology, 2021, 31(14): 3004-3016.e4.

Xu XW, Wei CX, Liu QY, Qu WQ, Qi XH, Xu Q, Chen XH*. The major-effect quantitative trait locus Fnl7.1 encodes a late embryogenesis abundant protein associated with fruit neck length in cucumber. Plant Biotechnology Journal, 2020, 18(7): 1598-1609.

Yang XD, Sanchez R, Kundariya H, Maher T, Dopp I, Schwegel R, Virdi K, Axtell MJ, Mackenzie SA*. Segregation of an MSH1 RNAi transgene produces heritable non-genetic memory in association with methylome reprogramming. Nature Communication, 2020, 11(1): 2214.

Kundariya H, Yang XD, Morton K, Sanchez R, Axtell MJ, Hutton SF, Fromm M, Mackenzie SA*. MSH1-induced heritable enhanced growth vigor through grafting is associated with the RdDM pathway in plants. Nat Communication, 2020, 11(1): 5343.

Qi XH, Li QQ, Ma X, Qian CL, Wang H, Ren NN, Shen C, Huang S, Xu XW, Xu Q, Chen XH*. Waterlogging-induced adventitious root formation in cucumber is regulated by ethylene and auxin through reactive oxygen species signaling. Plant, Cell & Environment, 2019, 42(5):1458-1470.

Yang XD, Mackenzie SA*. Many Facets of Dynamic Plasticity in Plants. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 2019, 11(10): a034629.

Xu XW, Liu XL, Yan YL, Wang W, Qi X, Xu Q, Chen XH*. Comparative proteomic analysis of cucumber powdery mildew resistance between a singlesegment substitution line and its recurrent parent. Horticulture Research, 2019, 6:115.

Xu XW, Ji J, Xu Q, Qi XH, Weng YQ*, Chen XH*. The major-effect quantitative trait locus CsARN6.1 encodes an AAA ATPase domain-containing protein that is associated with waterlogging stress tolerance by promoting adventitious root formation. The Plant Journal, 2018, 93(5): 917–930.

Xu Q, Xu X, Shi Y, Qi X, Chen XH*. Elucidation of the molecular responses of a cucumber segment substitution line carrying Pm5.1 and its recurrent parent triggered by powdery mildew by comparative transcriptome profiling. BMC Genomics, 2017, 18:21.

Xu XW, Chen M, Ji J, Xu Q, Qi XH, Chen XH*. Comparative RNA-seq based transcriptome profiling of waterlogging response in cucumber hypocotyls reveals novel insights into the de novo adventitious root primordia initiation. BMC Plant Biology 2017, 17: 129.

Xu XW, Ji J, Xu Q, Qi XH, Chen XH*. Inheritance and quantitative trail loci mapping of adventitious root numbers in cucumber seedlings under waterlogging conditions. Molecular Genetics and Genomics 2017, 292(2):353–364.

Xu XW, Yu T, Xu RX, Lin XJ, Xu Q, Qi XH, Weng YQ, Chen XH*. Fine mapping of a dominantly inherited powdery mildew resistance major-effect QTL, Pm1.1, in cucumber identifies a 41.1 kb region containing two tandemly arrayed cysteine-rich receptor-like protein kinase genes. Theoretical and Applied Genetics, 2016, 129(3):507-516.

Yang XD, Kundariya H, Xu YZ, Sandhu A, Yu J, Hutton SF, Zhang M, Mackenzie SA*. MutS HOMOLOG1-derived epigenetic breeding potential in tomato. Plant Physiology, 2015, 168(1): 222-232.

 

代表性专利:

蔡丛希,杨艳,陈学好,王一芃,王晏然,鞠昊伦,齐晓花,许学文. 与栽培型黄瓜果实亮度性状紧密连锁的SNP标记及应用,2023年8月22日,ZL202210054982.7.

许学文,王维,陈学好,齐晓花,徐强。与黄瓜抗白粉病紧密连锁的两个SNP标记及其应用,2021年7月20日,ZL201810861509.3.

Xiaodong Yang,Yizhuo Deng,Lili Zhang, ,Lei Qiu,Jieni Gu,Xuehao Chen。PROCESSING METHOD FOR INCREASING SEED PRODUCTION RATE OF SEED FRUITS OF CUCUMIS SATIVUS L,2025年4月29日,US 12,285,013 B2.

杨晓东,张丽丽,陈学好,刘筱玮,陈超妍,周蔚,邱磊,索春雨。编码MET1甲基化转移酶的基因及其在诱导黄瓜抗蚜育种中的应用,2025年2月28日,ZL 2024 1 0408402.9.

杨晓东,邓祎卓,张丽丽,邱磊,顾杰妮,陈学好。一种提高黄瓜种瓜制种率的处理方法, 2024年6月11日,  ZL 2023 1 1174307.9 .

杨晓东,张丽丽, 邱磊,顾杰妮,李紫怡,陈学好。一种基于转录组和DNA甲基化组的基因挖掘方法及系统, 2024年5月31日, ZL 2023 1 1536372.1.

张丽丽, 陈超妍,杨晓东,顾杰妮,邱磊,陈学好。 一种黄瓜抗蚜调控基因CsRBOHD及其应用, 2024年4月30日, ZL202311262039.6.


代表性科研成果

获得国家发明专利11件,1项专利获全国“一带一路”暨金砖国家技能发展与技术创新大赛金奖,选育应用黄瓜新品种14个,在Nature Communication, Genome Biology,Science Advances ,Current Biology,Plant Journal ,Plant Physiology,Plant Biotechnology Journal,Plant Communications,园艺学报,中国农业科学等期刊上发表论文近400篇,出版教材和著作5部,5项成果分别获教育部技术发明二等奖、江苏省科技成果二等奖、全国农牧渔业丰收奖一等奖、江苏省农学会科技奖技术创新奖一等奖、江苏省园艺学会青年科技奖。


近年来社会服务

通过江苏省黄瓜产业技术创新战略联盟、江苏淮阴黄瓜科技小院和江苏省科技镇长团等平台为省内外瓜菜基地、企业提供品种和技术支持。


研究生培养

学生可选择的研究方向

瓜菜重要农艺性状和品质性状优异基因挖掘、功能验证、基因编辑、分子调控网络和分子育种等。

学生成果

团队成员指导的本科生获得全国生命科学竞赛一等奖和全国大学生生命科学大赛特等奖,指导研究生获得中国研究生乡村振兴科技强农+创新大赛全国赛一等奖,中国研究生“美丽中国”创新设计大赛生物多样性保护与利用创新大赛全国总决赛一等奖。团队每年培养研究生10-15名,其中许学文博士获得2018年江苏省优秀博士论文,杨艳硕士荣获2023年江苏省优秀专业学位硕士学位论文。


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